Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Exo5Q9CXP9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Exo5Q9CXP9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms