Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ddx28Q9CWT6 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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