Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ctnnbl1Q9CWL8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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