Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg3Q9CPX6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg3Q9CPX6 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Atg3Q9CPX6 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Atg3Q9CPX6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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