Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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