Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nmd3Q99L48 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nmd3Q99L48 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nmd3Q99L48 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nmd3Q99L48 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nmd3Q99L48 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Nmd3Q99L48 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Nmd3Q99L48 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms