Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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