Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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