Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim11aQ99J19 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Smim11aQ99J19 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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