Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fcho1Q8K285 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Fcho1Q8K285 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Fcho1Q8K285 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms