Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Abcf3Q8K268 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Abcf3Q8K268 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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