Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hpf1Q8CFE2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hpf1Q8CFE2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms