Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Dclre1bQ8C7W7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Dclre1bQ8C7W7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Dclre1bQ8C7W7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Dclre1bQ8C7W7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Dclre1bQ8C7W7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dclre1bQ8C7W7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dclre1bQ8C7W7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms