Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpcpd1Q8C0L9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms