Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Cfap126-204ENSMUST00000129651 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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