Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cdca8Q8BHX3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms