Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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