Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms