Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmed3Q78IS1 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms