Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tmeff1Q6PFE7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms