Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd4Q6PDQ2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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