Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smchd1Q6P5D8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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