Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Tpm4Q6IRU2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm4Q6IRU2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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