Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nop58Q6DFW4 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms