Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q6DFW0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms