Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh3rf1Q69ZI1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms