Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim28Q62318 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms