Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Sox17Q61473 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sox17Q61473 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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