Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms