Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ulk4Q3V129 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ulk4Q3V129 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms