Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdm5aQ3UXZ9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Kdm5aQ3UXZ9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdm5aQ3UXZ9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.3 ms