Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms