Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q3U6N9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q3U6N9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Q3U6N9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Q3U6N9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Q3U6N9 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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