Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rpusd2Q149F1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd2Q149F1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms