Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms