Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Apoa1Q00623 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Apoa1Q00623 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms