Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Irx1P81068 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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