Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfixP70257 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfixP70257 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms