Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 4930543N07Rik-201ENSMUST00000209357 1364 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Flad1-201ENSMUST00000050398 3007 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Apex2-201ENSMUST00000026303 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Trim66-201ENSMUST00000033339 4354 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Clec7a-201ENSMUST00000112076 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Rnf43-201ENSMUST00000040089 3670 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Rsrc1-203ENSMUST00000065074 3224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Trappc9-201ENSMUST00000023276 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gnpda2-206ENSMUST00000166298 1755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Pde4b-205ENSMUST00000106904 2430 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm43790-201ENSMUST00000202694 2013 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rps28P62858 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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