Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp4P59240 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms