Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp25P57080 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms