Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Cldn18P56857 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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