Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf5P56477 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf5P56477 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Irf5P56477 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Irf5P56477 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Irf5P56477 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Irf5P56477 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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