Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmod1P49813 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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