Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms