Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrprbP47758 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms