Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ItgavP43406 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ItgavP43406 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ItgavP43406 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms