Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Clec3bP43025 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms