Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sftpa1P35242 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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