Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pde6aP27664 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pde6aP27664 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Pde6aP27664 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6aP27664 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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